儀軌，是由內到外，與諸佛菩薩相應的方式。
其中「內」的部分包含咒語和手印，有關咒語不要想像成電影變魔術般的招數，這是修行的專業方法之一，簡單來說行使的意義與要注意的方法如下：
一、對內的共鳴：
持咒必須配合呼吸，發音務必準確，發聲是身體被動性的經由氣流而發出共鳴，不是主動擠壓喉嚨發出聲音，以持咒去調整身體能量的頻率跟振動，而能將能量集合到最大，如何調整？要在安定與仔細觀察這兩個條件下去做，就像《心經》裡面提到的方法。
咒語的累積與修行相關，發願持咒一萬遍、十萬遍、百萬遍等，會有不同成果，但別忘了配合呼吸和正確的音頻，如果只是拿著計數器走來走去，心裡想著累積數字或消災祈福，你下意識其實在累積什麼？是不是貪念？
持咒達到相應後，能使用所祈請對象的力量，這也是修法過程中的練習，重點在於咒語的選擇與運用的問題。
例如蓮師八變，就是蓮花生大士修法與諸佛護法相應，相應成就者的形象，使用所祈請對象的力量，藉以辦理傳法的事業；不過相應不等於圓滿或是成就，成果是不相同的。
咒語根據不同法門有所不同，但是其字首字尾的分類、種子字的字音字形研究不是行者的任務，而是如何運用比較重要。